Su misión principal es fortalecer la comunicación social de la gestión del riesgo de desastres mediante tres procesos: conocimiento, reducción del riesgo, y manejo de desastres. Su estructura museológica se compone de cuatro salas: Historia, Memoria, Realidad aumentada y Caja de arena, dirigidas principalmente a la población infantil y juvenil. El museo se plantea conservar, registrar y documentar la colección histórica de la implementación de gestión del riesgo en el país (Ley1523/2012), para hacer de Colombia un territorio menos vulnerable y con comunidades más resilientes.La misión del Museo de Historia Natural es acercar al público general, de manera didáctica y recreativa, a la amplia biodiversidad colombiana y su relación con la humanidad en el pasado y el presente. Se caracteriza por ser un escenario de aprendizaje e interacción con el conocimiento científico. Allí, cada integrante de la sociedad tiene cabida para educarse sobre la evolución de los organismos, la adaptación natural, la diversidad biológica y cultural nacional, y sobre la conservación de las especies y los ecosistemas.

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